知网查重系统查重流程优化的步骤包括：1.优化文档格式；2.合理设置查重参数；3.定期清理历史数据；4.使用多种查重工具辅助；5.及时更新查重系统。

首先，优化文档格式是查重流程优化的重要一环。合理设置查重参数可以提高查重准确率，减少误差。定期清理历史数据可以保持系统运行效率。同时，使用多种查重工具辅助可以提高查重效率。最后，及时更新查重系统是保证系统正常运行的关键。通过以上步骤，可以有效优化知网查重系统的查重流程。